《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

于扁桃全基因组及转录组的盐胁迫相关生物学机制分析

来源:江苏农业科学杂志2025年第第24期北京时间:

作者:古丽那孜·阿布力克木;张冬冬;亚尔穆海麦提·阿卜力提普;魏祎然;何雅文;曾斌

单位:1.新疆农业大学园艺学院,新疆乌鲁木齐 830052; 2.新疆农业科学院园艺作物研究所,新疆乌鲁木齐 830091

摘要:扁桃是新疆喀什地区莎车县重要的经济果树之一,然而莎车县存在大面积的盐碱土地。盐胁迫是植物生长和发育过程中的一种重要环境压力。因此,深入探究不同浓度盐胁迫下扁桃基因的差异表达,解析扁桃耐盐机理及分子机制,对推动扁桃耐盐性遗传改良具有理论指导意义。为了解扁桃耐盐的机理生物学机制,利用转录组测序技术,并基于测序数据统计、比对率统计、样品间的重复性检验、差异基因表达数量统计、差异表达基因GO和KEGG富集进行分析。结果表明,在盐胁迫下,与对照相比,NaCl浓度达到100 mmol/L时,新疆扁桃“阿曼尼沙”叶片中的DEG数量达到最高(1 792个),其中762个DEG上调表达,1 030个DEG下调表达,共有1 956个DEG得到功能注释。GO和KEGG富集分析表明,涉及到的代谢通路有20条,在MAPK代谢通路、植物病原体互作和植物激素信号转导通路中是最显著且富集的。本研究获得的转录组数据信息可以揭示在盐胁迫环境下,代谢通路中差异表达基因的具体表达或被抑制状态,进而阐明扁桃应对盐碱环境的适应机理,为进一步鉴定和克隆出新疆扁桃的耐盐基因和培育新的耐盐品种提供理论依据。

关键词:扁桃;盐胁迫;差异基因;转录组测序

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