《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

月季GATA基因家族鉴定与表达分析

来源:江苏农业科学杂志2025年第第24期北京时间:

作者:陈浩源;郑旭东;朱晓国;程培蕾;严陶韬;林菁;黄长兵

单位:1.苏州农业职业技术学院,江苏苏州 215008; 2.阜阳师范大学生物与食品工程学院,安徽阜阳 236037

摘要:GATA转录因子是一类包含IV型锌指DNA结合结构域的转录调控蛋白,在调控植物生长发育中起着重要作用。多种植物中的GATA基因家族已被鉴定报道,然而,月季中的GATA家族基因尚未被鉴定。从月季基因组中鉴定出18个GATA家族成员,并对其理化性质、染色体分布、系统进化树、基因结构、顺式调控元件和同源基因进行分析,以期对月季GATA家族的功能进行初步预测。18个GATA基因不均匀地分布在月季的7条染色体上,长度在 153~1 021个氨基酸之间,等电点在4.87~11.39之间。系统进化树显示,RcGATA可分为4个亚家族,同一个亚家族的基因具有相似的结构和motif。分析RcGATA顺式作用元件发现,启动子上含有与植物激素、光响应、逆境胁迫相关的响应元件。共线性分析表明RcGATA家族中存在3对同源基因对。转录组数据分析表明,RcGATA的表达有一定的组织特异性,且RcGATA3、RcGATA10基因响应灰霉病的侵染,可能参与灰霉病的调控。

关键词:月季;GATA;基因家族;表达模式

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