《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:童琪;张梅;王陈;任少华;张驰强;李贵;陈瑞;吴敏;刘海燕
单位:1.贵州省植物园,贵州贵阳 550004; 2.湖南省林业科学院,湖南长沙 410004
摘要:为探究锥栗响应不同程度干旱胁迫的分子机制,挖掘与抗旱相关的功能基因,于2024年6月在贵阳市贵州省植物园试验基地温室进行,以锥栗幼苗为对象,设置对照组(CK)以及干旱胁迫D10、D20等2个处理组,采集叶片进行转录组测序和生物信息学分析,筛选锥栗响应干旱胁迫的相关差异基因。结果表明,干旱胁迫10 d后,共获得750个差异基因表达,其中229个上调,521个下调;干旱胁迫20 d后,共获得246个差异基因表达,其中140个上调,106个下调。GO富集分析发现,中度干旱胁迫下主要富集于蛋白磷酸化、DNA转录水平的调控和结合转录因子活性等;重度干旱胁迫下主要富集于蛋白磷酸化、防御应答、脱落酸应答和蛋白质结合等。KEGG代谢路径富集分析表明,中度干旱胁迫下主要富集在苯丙烷生物合成、植物激素信号转导、酪氨酸代谢途径;重度干旱胁迫下主要富集在植物激素信号转导、植物病原体互作、植物MAPK信号通路途径。结果表明,植物激素信号转导是干旱胁迫10、20 d条件下共同存在的代谢通路,证明这条代谢通路与锥栗抗旱性存在密切关联,从通路中筛选出表达量较高的基因7个,可能是锥栗响应干旱胁迫的关键基因。
关键词:锥栗;干旱胁迫;转录组;差异表达基因;GO分析;KEGG代谢路径分析;代谢通路