不同品种石斛根内生细菌和真菌群落多样性及功能分析

来源：江苏农业科学杂志2025年第第22期北京时间：

作者：王喜英;张露露;莫忠妹;谭智勇;赵辉;卢志宏;邓帮强

单位：1.铜仁学院，贵州铜仁 554300； 2.铜仁学院乡村振兴研究中心，贵州铜仁 554300； 3.贵州省高等学校山地国土空间智能监测与政策仿真工程研究中心，贵州铜仁 554300； 4.广西农业职业技术大学，广西南宁 530000； 5.德江县山顶中药材种植有限公司，贵州铜仁 554300

摘要：为探索石斛内生菌群落多样性的差异和潜在功能，采用高通量测序技术研究4种不同品种石斛根内生细菌和真菌的群落结构和多样性，并进行功能预测。结果表明，铁皮石斛的多糖含量最高，金钗石斛总生物碱、石斛碱和总黄酮含量最高，霍山石斛的总多酚含量最高。铁皮石斛根内生细菌的Chao1指数和Shannon指数均显著高于其他品种(P<0.05)，但其内生真菌的Chao1指数和Shannon指数均显著小于其他品种。在内生细菌和真菌门水平上，变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、子囊菌门和黄藻门为优势菌门。金钗石斛和霍山石斛的变形菌门相对丰度最高，铁皮石斛的拟杆菌门、放线菌门和子囊菌门相对丰度最高。PCA分析结果表明，不同品种石斛根内生细菌和真菌群落结构有明显差异，其中霍山石斛和铁皮石斛根内生细菌群落结构相似，金钗石斛和霍山石斛根内生真菌群落结构相似，鼓槌石斛与其他品种根内生细菌和真菌的群落结构差异较大。PICRUSt分析表明，铁皮石斛中新陈代谢功能基因丰度最高，环境信息处理功能基因丰度最低。FUNGuild功能预测结果表明，病原-腐生-共生营养型、腐生营养型和腐生-共生营养型内生真菌为主要的营养型。病原-腐生-共生营养型丰度在金钗石斛和铁皮石斛中最高，腐生营养型丰度在铁皮石斛中最低，腐生-共生营养型丰度在霍山石斛和鼓槌石斛中最高。该研究有利于更好地理解石斛与内生菌之间的共生关系，也可为后续微生物功能的挖掘和生物肥料的研究提供科学依据。

关键词：石斛;化学成分;内生细菌;内生真菌;功能预测