《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:陈德强;黄丽;祁岑;蒋红明
单位:1.北部湾大学,广西钦州 535011; 2.广西高校北部湾海产品高值化利用与预制食品重点实验室,广西钦州 535011
摘要:效应子是植物病原真菌重要的致病因子之一,直接影响病原真菌的侵入、扩展与危害。CFEM(common in fungal extracellular membrane)蛋白是一类真菌独有的特征蛋白,许多具有CFEM结构的分泌蛋白已被证明是病原真菌的效应子。利用蛋白质家族数据库Pfam对芒果亚洲炭疽菌(Colletotrichum asianum)的全基因组编码序列进行检索,共获得20个CFEM结构蛋白。对各CFEM蛋白的N末端信号肽、亚细胞定位和跨膜结构域特征进行生物信息学分析,结果显示,有9个CFEM蛋白被鉴定为分泌蛋白。最后,通过EffectorP软件评估预测得到5个CFEM候选效应子。RT-PCR分析结果表明,5个CFEM候选效应子在芒果亚洲炭疽菌侵染的不同阶段均有转录表达,其中在附着胞形成阶段特异表达的有1个(GQ607_015042),在活体营养阶段特异的表达有2个(GQ607_005238和GQ607_006403),在死体营养阶段特异表达的有1个(GQ607_011761),剩余1个(GQ607_008610)在病菌侵染的3个阶段均有表达。研究结果可为进一步探究芒果亚洲炭疽菌CFEM效应子的致病机理奠定基础。
关键词:芒果炭疽病;亚洲炭疽菌;CFEM效应子;生物信息学分析;特异表达