猪丹毒丝菌强毒株与弱毒疫苗株SpaA基因生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2020年第第17期北京时间：

作者：袁晓晴; 彭凌; 陈锦红; 温权; 刘博婷; 蔡巩林

单位：韶关学院英东生命科学学院/粤北生猪生产及疫病防控协同创新发展中心，广东韶关 512005

摘要：对猪丹毒丝菌SpaA蛋白进行生物信息学分析，并对比了猪丹毒丝菌弱毒菌株和野生强毒菌株间的差异。结果显示，由于猪丹毒丝菌GC42的SpaA蛋白缺少一段含有80个氨基酸的序列，使得该菌株的蛋白质相对分子质量、氨基酸组成、二级和三级结构与强毒株的SpaA蛋白质相比均有所差异，导致这2株菌株引发机体产生的免疫原性和抗原性强弱有所不同，推测这2株菌株中，SG7菌株的免疫原性相对GC42较强；GC42菌株的抗原性相对SG7菌株的抗原性来说较弱，而猪丹毒丝菌GC42菌株的毒力相对猪丹毒丝菌SG7菌株较弱，因此呈现弱毒菌株特性；推测2株菌株的氨基酸序列均在193~206、217~231、290~309、313~327、328~376、386~457区段具有较高的形成B细胞表位的可能性。

关键词：猪丹毒丝菌;SpaA蛋白;弱毒菌株;生物信息学分析;B细胞抗原表位