蔓花生AP2基因家族的生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2020年第第14期北京时间：

作者：王玲; 刘晓伟; 江纳; 付春

单位：1.乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室，四川乐山 614000；2.乐山师范学院生命科学学院，四川乐山 614000；3.乐山师范学院数学与信息科学学院，四川乐山 614000

摘要：AP2作为一类植物转录因子，在花的发育和营养器官的形成过程中都起着非常重要的作用。旨在对蔓花生(Arachis duranensis)AP2蛋白的理化性质及分子进化关系等进行详细的生物信息学分析。结果表明，蔓花生AP2基因家族成员编码蛋白亚细胞定位预测均在细胞核中，有11个成员的理论等电点小于7，推测该家族蛋白多为酸性蛋白，有8个成员存在2个保守结构域；该家族成员均无信号肽；除了Aradu.SE6Q0与Aradu.42K79成员中存在跨膜现象外，其他成员鲜少出现跨膜现象。亲疏水性预测结果表明，蔓花生AP2基因家族编码蛋白的亲疏水性系数均小于0，推测其为亲水蛋白；磷酸化位点主要集中在丝氨酸上；其二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。研究还得出，蔓花生AP2基因家族编码蛋白的主要保守基序是Motif1、Motif2和Motif4；Motif3、Motif4都含有YRG结构域，Motif5含有RAYD结构域；构建的系统发育树也有力地说明了AP2基因家族的进化程度。

关键词：蔓花生;AP2基因'AP2基因;基因家族;生物信息学