《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:李亚娇; 孙国琴; 郭九峰; 王海燕; 庞杰
单位:1.内蒙古自治区农牧业科学院蔬菜研究所,内蒙古呼和浩特 010031; 2.内蒙古大学物理科学与技术学院,内蒙古呼和浩特 010021
摘要:为探究内蒙古中部地区锡林郭勒草原蘑菇的遗传多样性及其进化特点,从分子水平上对89株草原蘑菇进行深入分析,旨在为后续草原蘑菇的种质资源创新和遗传改良提供理论依据。在内蒙古锡林郭勒盟白音锡勒草原地区采集草原蘑菇为试验材料提取基因组DNA,采用通用引物18S和ITS序列扩增片段进行PCR产物直接测序,利用BLAST、MEGA 6.0软件对测序结果进行比对分析,并以羊肚菌为外类群,分别构建系统进化树并计算分化时间。结果表明,89株草原蘑菇ITS序列中,保守位点数为275,变异位点数为268,简约信息位点数为180,单一位点数为88,覆盖率为330,简并位点:zore-fold为319、tow-fold为62、four-fold为40,G+C碱基平均含量:黑蘑为42.73%、白蘑为41.14%,遗传距离为0~0.45。ITS序列构建进化树结果表明,89株草原蘑菇分为3个类群,黑蘑1个类群、白蘑2个类群,且白蘑与黑蘑分化时间为11万年前,其中黑蘑中34号与其他黑蘑分化时间为3万年前,白蘑中B类群和C类群分化时间为1万年前。
关键词:草原蘑菇;ITS序列;分子系统发生学;系统进化树;分化时间