猪丹毒丝菌GAPDH线性B细胞表位预测与鉴定

来源：江苏农业科学杂志2021年第第22期北京时间：

作者：朱伟峰;陈露;谭凯;王高杰;蔡承志

单位：1.江苏省农业科学院兽医研究所，江苏南京 210014； 2.农业农村部兽用生物制品工程技术重点实验室，江苏南京 210014；3.国家兽用生物制品工程技术研究中心，江苏南京 210014； 4.华中农业大学动物医学院，湖北武汉 430070

摘要：为预测并鉴定猪丹毒丝菌甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)分子线性B细胞表位，首先通过多序列比分析已经全基因组测序的10株菌株的GAPDH一级结构保守性；然后使用在线软件Bepipred-2.0预测猪丹毒丝菌GAPDH线性B细胞表位，接下来通过人工化学合方式合成GAPDH表位对应的多肽；最后使用间接ELISA法检测这些多肽与猪丹毒丝菌GAPDH高免血清之间的反应。研究发现已经完成全基因组测序的10株菌株的GAPDH一级结构高度保守。通过软件预测，找到了猪丹毒丝菌GAPDH的3个潜在的表位。ELISA检测结果表明74VLSERDPKNLPWKELGV90和 178HAYTNDQNTLDGPHAKGDLRRGRAAAQSIIPNSTGA213 与GAPDH高免血清反应明显，是猪丹毒丝菌GAPDH的表位。成功预测并鉴定到2个猪丹毒丝菌的抗原表位，这些表位将为以后基于猪丹毒丝菌GAPDH表位的诊断、疫苗设计及致病机制研究提供技术基础。

关键词：猪丹毒丝菌;甘油醛-3-磷酸脱氢酶;保护性抗原;表位预测;表位鉴定