4种重要外来病毒高通量液相芯片检测方法的建立

来源：江苏农业科学杂志2021年第第13期北京时间：

作者：仇汝龙; 阮智杨; 胡波; 魏后军; 范志宇; 宋艳华; 陈萌萌; 徐为中; 王芳

单位：江苏省农业科学院兽医研究所/农业部兽用生物制品工程重点实验室，江苏南京 210014

摘要：为建立小反刍兽疫病毒(PPRV)、西尼罗病毒(WNV)、裂谷热病毒(RVFV)和南非型口蹄疫病毒(SAT FMDV)的高通量 液相芯片检测方法，根据GenBank上公布的PPRV的N蛋白基因序列、WNV的E蛋白基因序列、RVFV的S片段基因序列和FMDV的5′UTR区基因序列，并基于各基因保守区设计相应的引物和探针。通过对多重PCR的上游、下游引物比例、杂交温度、杂交时间进行条件优化，并验证检测方法的特异性和敏感性。敏感性试验显示，该方法对于PPRV、WNV、RVFV以及FMDV 4种病毒最低检出量分别为5.78×103、2.15×103、2.98×105、9.54×104 copies/μL。本研究建立的高通量液相芯片检测方法能够同时快速地检测4种外来病病毒，具有良好的特异性、敏感性和稳定性，对于流行病学调查和防范外来动物疫病具有重要的意义。

关键词：检测方法;液相芯片;基因序列;条件优化;流行病学