基于宏基因组测序分析耕作方式与秸秆还田对马铃薯根际土壤微生物群落的影响

来源：江苏农业科学杂志2025年第第21期北京时间：

作者：李濛池;马建华;黄修梅;张凤兰;杨忠仁;李明

单位：1.内蒙古农业大学职业技术学院，内蒙古包头 0141091； 2.内蒙古农业大学园艺与植物保护学院，内蒙古呼和浩特 010000

摘要：为探讨马铃薯根际土壤在不同耕作方式与秸秆还田条件下土壤微生物群落的差异，设置旋耕+秸秆还田(RS)、深翻+秸秆还田(PS)、深松+秸秆还田(SS)、常规耕作(CK)4种耕作方式，利用Illumina NovaSeq测序平台对不同耕作方式与秸秆还田条件下的马铃薯根际土壤进行宏基因组测序，分析微生物群落的组成。结果表明，土壤中微生物以细菌为主，约占90%，古菌约占4%，真菌及其他约占6%；非冗余基因数目以SS处理的基因数量最多；在门水平中，优势菌门包括变形菌门、放线菌门、黏球菌门、芽单胞菌门、酸杆菌门、拟杆菌门，其中变形菌门与放线菌门占比最高，PS处理的变形菌门和放线菌门相对丰度分别为55.88%和21.32%，均高于CK；在属水平中，优势菌门包括鞘氨醇单胞菌属、链霉菌属、慢生根瘤菌属、罗河杆菌属、抗砷溶杆菌属、芽单胞菌属、假单胞菌属、伯克霍尔德菌属、贪噬菌属，其中鞘氨醇单胞菌属占比最高，RS处理的鞘氨醇单胞菌属相对丰度为8.42%，高于CK。COG和CAZy功能基因注释结果显示，不同耕作措施主要相关功能基因的相对丰度均高于CK。KEGG功能预测分析表明，与CK相比，不同耕作措施的土壤环境中更容易富集与代谢相关的微生物。综上，该研究结果为今后不同耕作方式对马铃薯根际土壤微生物的影响研究提供一定的理论依据。

关键词：宏基因组;马铃薯根际土壤;耕作方式;秸秆还田;土壤微生物群落