《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:刘玲玲;程凌寒 ;张裕棠;方宇;余磊;刘佳妮
单位:1.昆明学院农学与生命科学学院/云南省都市特色农业工程技术研究中心,云南昆明 650214; 2.合肥高尔生命健康科学研究院有限公司,安徽合肥 230088
摘要:为揭示番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)对西花蓟马(Frankliniella occidentalis)共生细菌群落结构组成及潜在功能的影响,采用Illumina PE300测序技术对对照组西花蓟马和携带TSWV西花蓟马共生细菌的群落组成进行分析,并利用Tax4Fun法对共生细菌功能进行预测。结果表明,2组西花蓟马共生细菌群落组成与多样性存在一定差异。所有序列共被注释到13个门、22个纲、54个目、86个科和126个属。α多样性分析结果显示,携带TSWV西花蓟马与对照组相比共生细菌丰富度降低,但多样性有所升高。在门水平上,变形菌门、放线菌门和厚壁菌门为西花蓟马共生细菌的优势菌门,其中均以变形菌门相对丰度较高,2组中分别达到99.46%和97.27%;在属水平上,Rosenbergiella属是西花蓟马的优势菌属,对照组中Lechevalieria属、野野村氏菌属、微杆菌属、芽孢杆菌属及葡萄球菌属的相对丰度显著高于携带TSWV的西花蓟马,而布赫纳氏菌属、魏斯氏菌属和肠球菌属在西花蓟马携带TSWV后相对丰度显著增加(LDA>2;P<0.05)。另外,共生细菌的功能主要富集在碳水化合物代谢、氨基酸代谢、膜运输、辅助因子与维生素代谢及能量代谢等18种功能中,其中膜运输功能在携带TSWV西花蓟马中显著富集,但辅助因子与维生素代谢显著下降。总体而言,2组西花蓟马共生细菌的群落组成、多样性及功能存在一定差异。对照组西花蓟马主要显著聚集了与营养消化和吸收相关的菌属,而携带TSWV西花蓟马则显著聚集了有利于促进病毒传播和调控昆虫机体免疫的相关菌属且显著聚集的膜运输功能可能对TSWV病毒粒子的跨膜运输与传播具有重要作用。
关键词:番茄斑萎病毒;西花蓟马;共生细菌;功能预测;群落组成;多样性