苹果FAD基因家族的全基因组鉴定及盐胁迫响应机制分析

来源：江苏农业科学杂志2025年第第21期北京时间：

作者：胡晨阳;雒淑珍;张虹;陈文洲;徐成楠;程国亭;申飞;赵永欣;赵继荣

单位：1.延安大学生命科学学院/陕西省黄土高原资源植物研究与利用省市共建重点实验室，陕西延安 716000； 2.北京市农林科学院生物技术研究所/基因组育种技术研究室，北京100097

摘要：脂肪酸去饱和酶(FAD)作为植物脂质代谢的关键酶，在植物生长发育过程中发挥重要作用。对苹果(Malus×domestica Borkh.)FAD基因家族进行鉴定和分析，并研究其在盐胁迫下的表达模式，为开展苹果FAD基因家族的功能研究和遗传改良提供理论基础。运用生物信息学方法对苹果FAD(MdFAD)基因家族成员进行鉴定和理化性质、系统发育关系、染色体定位、基因结构与保守基序、顺式作用元件、种内共线性分析，以及采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对候选基因表达模式进行分析。在苹果基因组中共鉴定出35个MdFAD基因，划分为5个亚族，且同一亚族基因结构与保守基序高度保守；不均匀地分布在14条染色体上，种内共线性分析发现14次复制事件；顺式作用元件分析发现，MdFAD主要参与苹果生长发育过程中的激素响应调节和应激响应调节。qRT-PCR表达分析结果显示，MdFAD11和MdFAD28在盐胁迫初期显著上调表达，随后表达水平受到抑制，表明这2个基因在盐胁迫初期可能发挥重要的调控作用。在全基因组范围内鉴定出35个MdFAD基因家族成员，MdFAD11和MdFAD28在盐胁迫初期显著上调，对盐胁迫响应明显。

关键词：苹果;脂肪酸去饱和酶(FAD);基因家族;生物信息学;全基因组分析;盐胁迫;响应机制