大菱鲆响应恶臭假单胞菌感染的转录组及免疫相关基因分析

来源：江苏农业科学杂志2025年第第21期北京时间：

作者：李百玉;许星鸿;蔡嘉怡;席晨宵;王思婕;叶冠然;杨笑

单位：1.江苏海洋大学海洋科学与水产学院，江苏连云港 222005； 2.江苏海洋大学/江苏省海洋生物资源与环境重点实验室，江苏连云港 222005

摘要：为探究恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)感染对大菱鲆(Scophthalmus maximus)脾脏组织的基因表达水平的影响及大菱鲆的抗感染机制，以恶臭假单胞菌感染大菱鲆，比较对照组和感染组大菱鲆脾脏组织的转录组，筛选大菱鲆免疫相关基因和分析其应答病原菌感染的分子机制。结果显示，对照组和感染组大菱鲆脾脏组织存在2 015个差异表达基因，包括873个上调基因和1 142个下调基因。其中，与免疫相关的显著上调差异表达基因主要有细胞分裂控制蛋白(CDC42)、α-L-岩藻糖苷酶(FUCA2)和糖原合成酶激酶3β(GSK3B)等，显著下调的差异表达基因有新生多肽相关复合物亚基β(EGD1)、激活增强子结合蛋白4(AP4M1)以及整合素β4(ITGB4)等。GO功能注释显示，差异表达基因主要富集于细胞过程、结合和细胞内等功能。KEGG富集分析发现，有193条信号通路显著富集，其中，参与免疫应答的信号通路主要有黏着斑、溶酶体和细胞凋亡等。相关免疫基因可能与大菱鲆感染恶臭假单胞菌的免疫应答有关，为揭示大菱鲆感染恶臭假单胞菌的免疫应答机制、大菱鲆的病害防治和健康养殖提供依据。

关键词：大菱鲆;恶臭假单胞菌;转录组;免疫基因;脾脏;GO功能注释;KEGG富集;信号通路