《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:李红建;王青;方开星;倪尔冬;姜晓辉;秦丹丹;王秋霜;潘晨东;李波;吴华玲
单位:广东省农业科学院茶叶研究所/广东省茶树资源创新利用重点实验室,广东广州 510640
摘要:APC/C是一类多亚基E3泛素连接酶,在植物生长发育和逆境反应中起着重要作用。为研究茶树APC/C基因家族的特征,探讨其功能和在逆境适应中的潜在作用,利用生物信息学方法从茶树基因组中鉴定到15个APC/C基因,分析其染色体定位、基因结构、保守结构域及进化关系;基于转录组数据分析各成员组织表达特异性及在非生物胁迫、激素处理下的响应模式。结果表明,15个APC/C基因家族成员不均匀地分布在6条染色体上;其蛋白长度为 65~1 786 aa,分子量介于7.34~197.42 ku之间,等电点介于3.73~9.49之间。共线性分析结果显示,茶树APC/C基因家族成员与玫瑰同源基因亲缘关系较近,有7对基因存在共线性关系。启动子分析发现,茶树APC/C基因启动子中含有光响应元件最多。miRNA靶向预测显示,8个APC/C基因受16个miRNA靶向调控。表达模式分析结果显示,多数APC/C基因在茎和叶中表达量较高,且随着叶片成熟度增加表达量逐渐降低;APC/C基因在非生物胁迫和激素处理下呈现不同的响应模式。
关键词:茶树;APC/C基因家族;非生物胁迫;激素响应;表达模式