联合RNASeq和TMT技术挖掘大豆籽粒蛋白合成相关基因

来源：江苏农业科学杂志2025年第第17期北京时间：

作者：刘书华;陈千;张黎杰;周玲玲

单位：1.江苏省农业科学院宿迁农科所，江苏宿迁 223800； 2.扬州大学，江苏扬州 225000

摘要：蛋白是大豆重要品质性状，其表达受多基因网络协同调控，通过转录组和蛋白质组学联合分析挖掘蛋白质合成调控基因，为大豆蛋白遗传信息解析奠定基础。选用蛋白含量差异较大、表型相似的大豆高蛋白品种泗豆332和低蛋白品种嘉夏豆9号为研究材料，在大豆成熟期采取籽粒，利用RNA-Seq和TMT技术测序并进行生物信息学分析，挖掘大豆籽粒蛋白合成的相关基因。转录组和蛋白组学分别筛选到6 830个差异表达基因和1 405个差异表达蛋白，其中有387个基因在转录组和蛋白组学间均有显著差异。对差异表达基因和蛋白进行GO功能聚类分析发现，差异表达基因和蛋白主要涉及细胞、细胞部分、结合、催化活性、细胞过程及代谢过程等，趋势较为一致。对差异表达基因及蛋白的KEGG显著富集分析发现，差异表达基因或蛋白显著富集在核糖体、内质网蛋白加工、蛋白质出口等途径。对这些途径中的差异表达基因或蛋白进行汇总分析，筛选了18个可能直接或间接参与大豆籽粒蛋白合成调控的相关基因。这些基因的表达水平差异可能是导致不同基因型大豆籽粒蛋白呈现差异的重要原因，进一步丰富了大豆籽粒蛋白遗传信息的调控机制。

关键词：大豆;蛋白;RNA-Seq;TMT;联合分析;功能基因