水稻OsENOD93b基因组织表达模式与生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2021年第第7期北京时间：

作者：何雨航;杜易桓;郭昊;赵頔;马银花

单位：湖南人文科技学院农业与生物技术学院/农田杂草防控技术与应用协同创新中心，湖南娄底 417000

摘要：主要探究OsENOD93b基因在水稻中的组织表达模式，并对其作生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR技术分析OsENOD93b基因的表达模式。用ExPASy-Protparam、Protscale、CDD、SOPMA、Phyre 2、Psort等在线工具对OsENOD93b进行生物信息学分析。经组织表达模式分析可知，OsENOD93b基因在叶片中的含量最多，其次是茎，含量最少的为根。通过ExPASy-Protparam分析发现，OsENOD93b分子量为16.429 89 ku，是一种具有亲水性的不稳定的碱性蛋白。该蛋白属于ENOD93超级家族。通过SOPMA在线软件对OsENOD93b蛋白的二级结构进行分析预测，发现其由无规则卷曲(41.56%)、α-螺旋(39.61%)、延伸链区(14.94%)和β-转角(3.90%)4种形式组成。此外，利用不同在线工具对OsENOD93b蛋白的三级结构、保守区域、亚细胞定位进行生物信息学分析。结果表明，OsENOD93b基因在进化过程中具有一定的保守性，并有多样的潜在功能待研究。研究结果为进一步探明OsENOD93b基因的生物学功能提供了依据。

关键词：水稻;ENOD;OsENOD93b;组织表达模式分析;生物信息学