沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2021年第第6期北京时间：

作者：杨艳北;许晶;李袁飞;贡继尚;饶友生

单位：1.南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室，江西南昌 330000； 2.南昌师范学院生物系，江西南昌 330000

摘要：LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统，从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件，分析LuxR家族调控蛋白序列，对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测，为后续研究生物被膜形成机制奠定基础，也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路。结果表明：LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白；定位在细菌的细胞质中；无信号肽结构，推断其为非分泌性蛋白；二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件；α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义；含有5个磷酸化位点，其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸，其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸；无跨膜结构域，推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白；LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统，含有2个保守结构域，分别为Autoind_bind和 HTH_LUXR，该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用。

关键词：沼泽红假单胞菌;LuxR;生物信息学;生物被膜