西北地区大蒜及其野生蒜SSR-PCR体系优化及引物筛选

来源：江苏农业科学杂志2022年第第18期北京时间：

作者：李守明;史荣梅;李辉玲

单位：1.石河子农业科学研究院，新疆石河子 832000； 2.新疆埃乐欣药业有限公司，新疆乌鲁木齐 830000；3.巴音郭楞蒙古自治州农业科学研究院，新疆库尔勒 841000

摘要：为探索了解西北地区大蒜及其野生蒜资源之间的亲缘关系及变异特性，以25份西北地区及野生大蒜鳞茎和叶片为材料提取模板DNA，筛选适于简单重复序列(SSR)-PCR的反应体系。采用L16(43)正交表设计正交试验并进行单因素试验，对影响大蒜SSR-PCR的相关体系参数进行优化。结果表明，适用于大蒜的SSR反应体系总体积为10 μL：模板DNA 30.0 ng，正反引物均为0.5 μmol/L，2×Taq PCR Mix 5.0 μL，其余用dd H2O补齐。扩增程序：94 ℃预变性3 min；94 ℃变性30 s，不同引物最佳退火温度退火45 s，72 ℃延伸90 s；30次循环的最后1次循环72 ℃延伸设为10 min，4 ℃保存扩增产物。最终在上述PCR条件下从50对SSR通用引物中筛选出13对多态性好、稳定性高的适用于大蒜SSR-PCR多样性分析的候选引物。

关键词：大蒜;SSR-PCR;优化反应;引物筛选;扩增产物