基于芯片筛选螺原体感染中华绒螯蟹血细胞的免疫microRNAs

来源：江苏农业科学杂志2022年第第17期北京时间：

作者：欧江涛;蒋启程;周刻焱;柳巧;栾筱琪;王资生;张启焕

单位：盐城工学院海洋与生物工程学院，江苏盐城 224051

摘要：为筛选分析螺原体(Spiroplasma eriocheiris)感染中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)血细胞免疫相关microRNAs(miRNA)及其差异表达情况，利用微流体芯片技术，对正常和感染螺原体的中华绒螯蟹血细胞miRNA进行系统的鉴定与表达检测；结合生物信息学方法，分析其靶基因和免疫信号通路。利用前期研究和已有报道897条成熟miRNA作为探针订制单色芯片，使用Cy3染料标记，通过与中华绒螯蟹血细胞总RNA样本杂交，鉴定miRNA，检测其表达情况；对差异表达的miRNA进行靶基因预测、功能聚类和通路分析；随机挑选部分差异表达的miRNA进行茎环RT-qPCR验证。结果显示，总共鉴定出中华绒螯蟹血细胞miRNA共303个；健康组和试验组共表达miRNA有48个；差异表达miRNA为27个，其靶基因共注释到116个GO和63个KEGG通路；通过茎环RT-qPCR检测，结果与芯片基本一致。研究发现，差异表达miRNA靶基因，许多均存在于重要免疫信号通路之中，研究结果可为进一步分析中华绒螯蟹血细胞螺原体感染中的miRNA与其靶基因间的免疫调控机制提供借鉴。

关键词：中华绒螯蟹;螺原体;microRNA;微流体芯片