细胞保护蛋白PTD-FNK生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2022年第第15期北京时间：

作者：纪伟霞;胡传活;马祺琦;何芝凤;黄芳;汪燕玲

单位：1.广西大学动物科学技术学院，广西南宁 530004； 2.广西壮族自治区畜牧研究所，广西南宁 530001

摘要：PTD-FNK蛋白是人工形成的重组蛋白质，已被证明在细胞凋亡、精子冷冻保存过程中对细胞有一定的保护作用，虽然在实践中应用普遍，但国内未见其机理分析和通过蛋白结合参与调控的报道。结合Protparam、ProtScale等相关在线软件预测和分析PTD-FNK蛋白的理化性质、亲水性、二、三级结构等；分离培养猪睾丸支持细胞，采用HIS pulldown技术拉下PTD-FNK未知的互作蛋白，得到的数据用UniProt数据库对比。生物信息学结果表明，PTD-FNK蛋白编码295个氨基酸，蛋白质分子量33.195 ku，分子式为C1 456H2 225N437O439S10；该蛋白含有PKC、PKA特异性磷酸化的结合位点。得到的互作蛋白有葡萄糖调节蛋白78、波形蛋白-1、组蛋白等。预测PTD-FNK蛋白可能通过PKA、PKC特异性磷酸化结合位点或者与蛋白互作的方式参与细胞凋亡、精子发生等过程。

关键词：PTD-FNK蛋白;抗凋亡;内质网应激;生物信息学分析;免疫共沉淀;互作蛋白