秋茄WRKY基因家族的生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2022年第第14期北京时间：

作者：丁祥青;胡敏杰;向双;赖兴凯;乐易迅;刘仲健;邹双全

单位：1.福建农林大学园林学院，福建福州，350002； 2.福建师范大学地理科学学院，福建福州 350007；3.福建农林大学林学院，福建福州 350002； 4.泉州湾河口湿地自然保护区管理处，福建泉州 362000

摘要：WRKY蛋白在植物胁迫响应和应答过程中发挥着重要作用。秋茄生长环境恶劣，生存压力使其进化出极强的胁迫响应能力，对各种胁迫的响应是决定秋茄逆境生存的重要因素。目前，关于秋茄WRKY基因家族的研究报道较少。对秋茄WRKY基因家族进行全面的研究，共鉴定出71个KcWRKY基因。结构域分析和进化分析结果表明，KcWRKY基因高度保守且分为3组。保守基序分析结果表明，同组的KcWRKY基因基序分布一致而组间差异显著，说明同组的KcWRKY基因可能具有相似的功能。染色体定位和复制关系表明，71个KcWRKY基因不均匀分布在秋茄基因组18条染色体上，存在4对串联重复基因和大量片段复制基因，这些基因可能在秋茄胁迫响应进化历程中发挥了重要作用。根据KcWRKY基因在不同器官的表达模式推测KcWRKY71参与调节编码线粒体和叶绿体蛋白的胁迫响应，KcWRKY66参与秋茄叶和果衰老的调节。本研究揭示了秋茄WRKY转录因子的基本结构与性质，研究结果能为后续深入研究秋茄WRKY转录因子的功能奠定基础。

关键词：秋茄;WRKY转录因子;基因家族;生物信息分析