《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:张来斌;马光皇;刘语涵;贺鹏鹏;肖海兵;杨明禄
单位:1.塔里木大学农学院,新疆阿拉尔 843300; 2.南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室,新疆阿拉尔 843300
摘要:分析枣瘿蚊图尔病毒(DjTV-2a)衣壳蛋白的理化性质、蛋白结构及抗原表位。从UniProt数据库中得到DjTV-2a衣壳蛋白的氨基酸序列,利用Expasy、TMHMM、DNAStar、SignalP 5.0、TMHMM、NetPhos 3.1、NET CGlyc 1.0、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学软件,预测DjTV-2a衣壳蛋白的理化性质、氨基酸组成、亲疏水性、信号肽、跨膜结构、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构和抗原表位等。结果表明,DjTV-2a衣壳蛋白是由449个氨基酸构成的亲水蛋白,分子式为C2 337H3 607N601O689S15,分子量为51.6 ku,理论等电点为5.98;主要二级结构是无规则卷曲,存在82个磷酸化位点和1个糖基化位点,无信号肽和跨膜结构;该蛋白有21个B细胞优势抗原表位和10个T细胞优势抗原表位。DjTV-2a衣壳蛋白属亲水蛋白,具有多个抗原表位,预测其具有免疫原性,是可用作建立血清学检测技术的潜在抗原。
关键词:枣瘿蚊;图尔病毒;衣壳蛋白;生物信息学;抗原表位