稻虾共养病虾肠道细菌群落变化与病原细菌分离及药物敏感性

来源：江苏农业科学杂志2022年第第8期北京时间：

作者：石晓媛; 王麒; 方明棵; 王莹; 杨亚珍; 朱建强

单位：1.长江大学生命科学学院，湖北荆州 434025； 2.长江大学农学院，湖北荆州 434025

摘要：病害是影响稻虾共养农民经济收入的重要因素。为明确稻虾共养发病塘口中致病菌的种类及其防治方法，以健康虾和病虾为研究材料，运用Illumina MiSeq全基因组测序技术，对健康虾和病虾肠道内细菌的群落组成进行测定和分析，预估出病原菌的种类。在此基础上，使用选择性培养基对病虾肠道内疑似病原菌进行分离。将分离所获疑似病原菌注射至健康虾体肠道内，并观察虾体死亡情况，最终确定所选病原菌菌株。通过显微观察、16S rDNA序列分析，最终确定该病原菌的分类地位。最后利用药敏性试验，筛选出对该病原菌有抑制效果的抗生素和中草药种类。试验结果表明，健康虾与病原虾肠道内的细菌群落结构具有显著性差异。在门水平上，健康虾肠道内细菌主要是柔壁菌门，其相对丰度为74.23%；而病虾肠道内细菌主要是变形菌门，其相对丰度为67.39%；在属水平上，健康虾肠道内主要是柔膜菌属，其相对丰度为48.30%；病虾肠道内主要是非保密气单胞菌属，其相对丰度为13.50%。分离结果显示，所获8株细菌均为革兰氏阴性菌，在选择性培养基上均呈黄色。病原菌回接感染结果表明，1.5×108 CFU/mL注射后1 d内，致死率高达100%。分子学鉴定结果表明，该病原菌为哈夫尼菌属蜂房哈夫尼菌。该菌对所选的卡那霉素、诺氟沙星、氧氟沙星、环丙沙星、氯霉素这5种抗生素比较敏感；对黄芩、苦参、艾叶等3种中草药水提物比较敏感。本研究可为稻虾共养流行病的诊断及防治，以及小龙虾的健康养殖提供理论依据。

关键词：克氏原螯虾;病原微生物;分离鉴定;防治;药物敏感性;蜂房哈夫尼菌