希金斯炭疽菌中NPFxD基序蛋白找寻及其生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2022年第第5期北京时间：

作者：陈光建; 覃悦; 韩长志

单位：1.西南林业大学生物多样性保护学院，云南昆明 650224； 2.西南林业大学研究生院，云南昆明 650224；3.云南省森林灾害预警与控制重点实验室，云南昆明 650224

摘要：希金斯炭疽菌是一种半活体营养型植物炭疽病原真菌，能够侵染多种十字花科植物引起的炭疽病，特别是引起蔬菜炭疽病的重要病原。胞吞在真菌侵染植物过程中发挥着重要作用，该作用一般同具有NPFxD基序的蛋白受体介导有关，然而，目前有关该炭疽菌中胞吞作用相关蛋白尚未明确。基于前人已报道的构巢曲霉中NPFxD蛋白序列，通过关键词搜索以及Blastp比对等方法对希金斯炭疽菌蛋白质数据库进行NPFxD蛋白找寻，明确该菌中存在2个NPFxD蛋白序列，根据蛋白同源性，分别命名为ChMYO1、ChGBP2。同时，对这2个蛋白序列开展了保守结构域及跨膜区结构、蛋白质理化性、信号肽、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析。结果表明，ChMYO1、ChGBP2蛋白亚细胞定位情况不同，前者定位在质膜，后者定位在核内；两者在亲疏水性、最高氨基酸残基和其位置等均有着一定差异；两者均无明显的信号肽序列；两者均含有无规则卷曲、α螺旋、β卷曲，而缺乏TM螺旋。此外，对多个不同真菌中NPFxD基序同源蛋白序列开展遗传关系分析，明确希金斯炭疽菌中的NPFxD基序蛋白与炭疽菌属中其他病菌中的蛋白具有较高的同源性，本研究为进一步研究炭疽菌属NPFxD基序蛋白的功能提供了理论参考。

关键词：胞吞作用;希金斯炭疽菌;NPFxD基序蛋白;生物信息学