紫芽六堡茶转录组SSR位点序列分析

来源：江苏农业科学杂志2022年第第3期北京时间：

作者：梁燕妮; 黄银霞; 魏诗琴; 陈秋雨

单位：梧州学院，广西梧州 543002

摘要：以广西梧州紫芽六堡茶为研究对象，运用MISA软件对转录组测序获得的165 570 条unigene序列(总长度为240 177 233 bp)，进行SSR位点搜索。使用Excel软件对SSR位点的出现频率、基元类型、基元组成、平均距离等进行处理分析。结果表明，共在10 058 条unigene中找到符合条件的SSR位点11 482个，出现频率为6.93%，平均距离为20.92 kb，平均长度为20.80 bp。紫芽六堡茶转录组SSR中，双碱基重复是主要的重复类型，占总SSR的1903%，GA/TC、GAA/TTC、AAAT/ATTT、AAAAG/CTTTT分别是双碱基、三碱基、四碱基、五碱基的优势重复单元。序列长度大于20 bp的SSR位点数占总SSR的44.05%，其中长度为24 bp的SSR位点数最多，占SSR总数的16.01%。说明紫芽六堡茶转录组SSR种类丰富、可用性高、多态性高。通过对SSR位点的分布特征和序列特征进行分析，可为后续六堡茶的进化、品种鉴定、分子育种等研究提供依据。

关键词：茶树;六堡茶;转录组;SSR位点;序列分析