脊尾白虾响应环境胁迫的转录组学分析

来源：江苏农业科学杂志2022年第第3期北京时间：

作者：王兴强; 卢雪旎; 沈晔; 曹梅; 韦寿永; 李庆国; 茆丹婷; 秦传新

单位：1.江苏海洋大学海洋科学与水产学院，江苏连云港 222005； 2.连云港旺岛旅游开发有限公司，江苏连云港 222000；3. 中国水产科学研究院南海水产研究所，广东广州 510300

摘要：脊尾白虾(Palaemon carinicauda)是我国沿海滩涂混养的重要经济虾类，具有广盐、广温、抗病力和繁殖力强等优点。采用高通量测序技术对脊尾白虾转录组进行测序，对得到的转录本进行COG(clusters of orthologous groups)、GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)分类和注释，旨在深入探讨环境胁迫(低盐、低温和溶解氧)对脊尾白虾重要相关调控基因的影响。本次测序低盐、低温和溶解氧处理组和对照组均产出>35×106条高质量序列，碱基数均>4 Gb，GC含量均>43%，Q30碱基百分比均>92%。组装得到转录本436 023条和unigene 305 682条，转录本和unigene的N50分别是814 bp和552 bp。unigene大部分(56 898条)注释到NR数据库，31 695条注释到KEGG数据库，28 919条注释到GO数据库。低温胁迫产生的差异表达基因中，具有显著性表达差异的有264条，包括上调基因215条和下调基因49条；低氧胁迫没有产生显著差异表达的基因，反观低盐胁迫有且仅有1条显著下调的基因，为α-葡糖苷酶(α-glucosidase)。低盐胁迫下α-葡萄糖苷酶表达量显著降低，可能导致脊尾白虾虾体难以维持正常的能量需求。GO富集分析发现，低温胁迫下最显著的功能节点是脂质转运活性(lipid transporter activity)和肽基二肽酶活性(peptidyl-dipeptidase activity)；而KEGG通路富集分析显示，差异表达基因显著富集到肾素-血管紧张素系统(renin-angiotensin system)中，推测低温通过抑制血管紧张素转换酶(angiotensin converting enzyme)的表达，降低了血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ)的生成，从而降低血管平滑肌张力，抑制血压的升高和组织损伤；同时动员脂肪和蛋白质等能源物质，以响应低温胁迫。

关键词：脊尾白虾;环境胁迫;转录组分析;差异表达基因;高通量测序