基于高通量测序技术鉴定栽培草莓资源携带的病毒种类

来源：江苏农业科学杂志2023年第第19期北京时间：

作者：刘思佳;曾祥国;肖桂林;王涌;韩永超

单位：1.湖北省农业科学院经济作物研究所，湖北武汉 430072； 2.华中农业大学园艺林学学院，湖北武汉 430070

摘要：分析草莓种质资源的病毒携带情况，为草莓脱毒种苗的繁育和病毒病的防治提供依据。针对保存的86份栽培草莓材料，分别提取每份材料的叶片总RNA，将待测草莓总RNA混样，然后采用高通量测序技术进行测序。根据每种病毒的序列保守区设计引物，采用RT-PCR对高通量测序的结果进行验证。利用设计的引物分别对每份草莓品种材料进行RT-PCR检测，明确每份材料的带毒情况。测序结果表明，从86份草莓资源中检测出3种病毒，分别为草莓斑驳病毒(strawberry mottle virus，简称SMoV)、草莓镶脉病毒(strawberry vein banding virus，简称SVBV)和草莓白化病毒(strawberry pallidosis-associated virus，简称SPaV)，该结果与RT-PCR验证的结果相符。在所有86份供试样品中，28份材料带有病毒，病毒感染率为32.56%；其中，23份材料带有SVBV；11份材料带有SMoV；5份材料带有SPaV。单一病毒侵染样品18份，复合侵染材料共10份，草莓种苗带毒率高，草莓病毒病危害严重。

关键词：草莓;病毒病;高通量测序;RT-PCR;草莓白化病毒