贵州白山羊FHL3基因多态性与生长性状关联分析

来源：江苏农业科学杂志2023年第第13期北京时间：

作者：安清明;杨驰;宋兴超;赵园园;陈敏;申建江;高伟

单位：1.铜仁学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室/铜仁学院农林工程与规划学院，贵州铜仁 554300；2.贵州省黔东南苗族侗族自治州畜牧技术推广站，贵州凯里 556000； 3.贵州省务川仡佬族苗族自治县农业农村局，贵州务川 564300

摘要：筛选贵州白山羊FHL3基因单核苷酸变异位点(SNPs)，并分析基因多态性与生长性状的关联性，为培育贵州白山羊优良品系提供参考依据，也为进一步研究FHL3基因生物学功能奠定基础。通过混合池测序对116只不同地区贵州白山羊FHL3基因进行SNPs鉴定，以188只贵州白山羊进行关联性分析。采用PopGene32.0软件计算等位基因频率、基因型频率、遗传纯合度(Ho)、期望杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)，应用PIC软件计算群体多态性信息含量(PIC)，以卡方(χ2)检验分析基因Hardy-Weinberg平衡状态；应用MINTAB软件中的一般线性混合效应模型分析核苷酸变异与生长性状关联性。结果表明，贵州白山羊FHL3基因的6个检测区域中，仅在P3区域检测到1个核苷酸变异位点g.215 C/T，且该位点的Ho低于He，PIC检测为中度多态，χ2检验结果表明，该位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。关联分析结果表明，贵州白山羊FHL3基因g.215 C/T位点变异构成的不同等位基因和基因型在体高、体长和胸围方面表现出显著差异性(P<0.05)，存在等位基因C的群体和CC基因型群体具有更高的生长优势。贵州白山羊FHL3基因具有一定的多态性，且g.215 C/T位点变异与体高、体长和胸围具有显著相关性，可作为培育贵州白山羊优良品系的候选基因分子标记。

关键词：贵州白山羊;FHL3基因'FHL3基因;生长性状;关联分析