不同营养类型培养基番茄内生细菌群落结构研究

来源：江苏农业科学杂志2023年第第11期北京时间：

作者：张泽宇;肖扬;詹亚斌;魏雨泉;徐道清;李季

单位：1.中国农业大学资源与环境学院，北京 100193； 2.中国农业大学水利与土木工程学院，北京 100083；3.中国农业大学有机循环研究院(苏州)，江苏苏州 215100； 4.安徽省农业科学院棉花研究所，安徽安庆 230041

摘要：通过采用Biolog EcoPlate 培养、16S r RNA基因高通量测序技术等方法研究不同培养基上植物内生细菌群落结构的组成差异，探究不同培养基等营养条件对番茄内生细菌群落结构的影响。结果表明：(1)4种培养基上生长的内生菌群在Biolog EcoPlate 微平板培养96 h 后，菌群生长达到稳定期，且在牛肉膏蛋白胨(NA)培养基下菌群代谢活性较高。R2A培养基下菌群代谢活性较低。(2) 番茄内生微生物组包括柠檬酸杆菌属(Citroebacteria)、芽孢杆菌属(Bacillus)、鞘脂单胞菌(Sphingbacterium)、布克氏菌属(Burkholderia)。(3)LB、TSA培养基分离到的内生菌多为芽孢杆菌属；在NA、R2A培养基中番茄内生菌组成多为柠檬酸杆菌、芽孢杆菌、鞘脂单胞菌、布克氏菌，为优势菌种。(4)NA培养基中番茄内生微生物组香农指数高于其他处理(P<0.05)差异；PCoA分析显示4种培养基中番茄内生细菌群落结构具有差异(P<0.05)。(5)网络分析发现NA、R2A培养基中番茄内生细菌微生物组模块化水平更高，而且网络拓扑性更高。(6)LEfSe分析发现，LB富集的物种为芽孢杆菌，NA培养基富集物种多为假单胞菌(Pseudomonas)，R2A培养基富集物种多鞘脂单胞菌，TSA培养基富集物种多布克氏菌属。 本研究通过高通量测序分析不同营养类型培养基对番茄内生微生物组群落结构的影响，对于生产中通过利用营养条件调控植物内生菌群群落结构组成及靶向筛选有益微生物具有重要的指导意义。

关键词：培养基;营养条件;Biolog EcoPlate微平板;16S rRNA基因高通量测序;内生菌群