《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

牡丹YABBY基因家族的全基因组鉴定、表征及表达分析

来源:江苏农业科学杂志2025年第第16期北京时间:

作者:刘仲阳;杨斌;张中起;王连祥;时晶晶;吕令华;苑红霞

单位:1.菏泽市农业科学院试验示范开发服务中心,山东菏泽 274000; 2.菏泽市农业科学院,山东菏泽 274000; 3.山东省菏泽市牡丹区林业局,山东菏泽 274000

摘要:对牡丹YABBY基因家族进行全基因组鉴定和表征,分析其在牡丹种子不同发育时期以及响应高温胁迫中的表达模式,以期为明确牡丹YABBY基因家族功能提供理论基础。通过生物信息学的方法分析牡丹YABBY基因的染色体定位、理化性质、基因结构、蛋白基序、启动子元件、基因复制、系统进化关系和表达模式等。结果表明,牡丹基因组有8个YABBY基因,其编码蛋白多为亲水性蛋白。牡丹YABBY基因家族存在1对由片段复制产生的旁系同源基因PosYABBY1~PosYABBY8。牡丹YABBY基因的启动子区域具有与生长发育、干旱胁迫、高温胁迫和激素响应相关的顺式调控作用元件。PosYABBY1、PosYABBY4和PosYABBY5在种子发育过程中优势表达,可能参与牡丹种子发育的调控过程。PosYABBY4、PosYABBY5和PosYABBY7受高温胁迫上调表达,而PosYABBY1、PosYABBY6和PosYABBY8受高温胁迫下调表达,它们可能参与到牡丹响应高温胁迫的调控过程。牡丹YABBY蛋白主要与植物形态建成、生长素调控和致病过程等的相关蛋白互作。研究结果可为牡丹YABBY基因功能的进一步验证和遗传利用提供数据参考。

关键词:牡丹;YABBY;鉴定;表达特征;蛋白互作

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