《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

基于多组学和AlphaFold2对稻瘟灵防治稻瘟病菌的靶标鉴定

来源:江苏农业科学杂志2025年第第14期北京时间:

作者:凤舞剑;陶佩琳;王婷婷;白耀博;赵虎

单位:徐州生物工程职业技术学院/徐州市现代农业生物技术重点实验室,江苏徐州 221006

摘要:为了分析稻瘟灵影响稻瘟病菌的关键功能和靶标,测试稻瘟灵抑制稻瘟病菌的最佳浓度,并利用转录组学、代谢组学和结构生物学方法,比较分析稻瘟灵处理稻瘟病菌后的基因、代谢物表达差异,同时利用AlphaFold2、分子对接方法对潜在靶标进行分子模拟和预测。结果表明,稻瘟灵抑制稻瘟病菌的半数效应浓度(EC50)约为17.5 μmol/L,共鉴定到上调的差异基因数量为1 055个,下调的差异基因数量为1 846个。GO功能富集分析结果表明,用稻瘟灵处理稻瘟病菌后,使用差异基因富集的功能包括乳酸代谢、氧化还原酶活性、酰胺结合、多糖结合、碳水化合物代谢、β-葡萄糖苷酶等;受到影响的KEGG通路包括淀粉和糖代谢、氮、甘油酯代谢、脂肪酸降解和蛋白激酶等;通过基因和代谢物共表达网络分析,鉴定到3个脂质相关蛋白与稻瘟灵的相关性较高,但分子对接结果表明,仅MGG_00435编码的膜蛋白、MGG_05433编码的溶质运载家族6蛋白与稻瘟灵结合。

关键词:稻瘟病菌;稻瘟灵;分子对接;AlphaFold2;防治靶标

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