石榴OFP基因家族的全基因组鉴定与表达分析

来源：江苏农业科学杂志2025年第第14期北京时间：

作者：李晓静;鲁海菊;张彭倩;陈仕艳;蔡怡婷;岳亮亮

单位：1.红河学院生物科学与农学学院，云南蒙自 661100； 2.西南林业大学高原湿地中心，云南昆明 650224

摘要：卵形家族蛋白(ovate family proteins，OFP)转录因子在植物体生长发育过程和对胁迫的响应中起着重要作用。以石榴基因组数据为基础，利用生物信息学方法开展OFP基因家族成员的鉴定及染色体定位、蛋白理化性质、系统进化关系、保守基序、基因结构、顺式作用元件及表达模式分析。结果表明，从石榴基因组中共鉴定到17个OFP基因，分布在除4号、7号染色体外的其他6条染色体上，其中5号染色体上分布的基因最多，分别有PgOFP10、PgOFP11、PgOFP12、PgOFP13和PgOFP14。17个OFP基因可划分为3个亚家族。PgOFP基因的结构相对简单，大多数基因没有内含子，而PgOFP2、PgOFP6和PgOFP15只有1个内含子。17个PgOFP基因的启动子区域含有大量植物激素响应及逆境应答相关的顺式作用元件。表达分析结果表明，PgOFP15在根、叶片中高表达，推测PgOFP15在叶片、根发育过程中起重要作用。PgOFP1在大多数的组织中高表达，并且随着果皮的发育，其相对表达量呈逐渐升高的趋势，推测PgOFP1有可能在石榴果皮发育中起到重要作用。17个石榴OFP基因在NaCl盐胁迫的样品中表现出差异表达。PgOFP1、PgOFP6、PgOFP8在大多数盐胁迫样品中高表达。在受到盐胁迫后，PgOFP1的相对表达量在处理后3 d的根中达到高峰，在处理后3 d的叶片中达到最低值。喷施不同浓度的ABA后，PgOFP2、PgOFP9、PgOFP7在部分ABA处理的样品中不表达，PgOFP1、PgOFP6在所有样品中高表达。由研究结果可以推测，PgOFP基因家族可能在响应逆境胁迫中发挥着重要作用。

关键词：石榴;OFP基因家族;表达分析;全基因组;逆境胁迫