《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:胡文婷;荆赞革;裴徐梨;张昱;焦鹏;冯鹏宇;王定康;宋立晓;徐胜光;昂海燕
单位:1.云南省高校生物炭工程研究中心/昆明学院农学与生命科学学院,云南昆明 650214;2.江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所,江苏南京 210014
摘要:RPW8是植物广谱抗病蛋白,是抗病育种的优良基因来源之一。利用生物信息学方法对南瓜RPW8基因家族成员等其他葫芦科植物RPW8基因家族成员进行鉴定、序列特征、共线性和系统进化分析;利用RT-qPCR技术检测南瓜RPW8基因响应白粉病侵染的表达特征。结果表明:从南瓜中鉴定出6个RPW8基因家族成员;其编码的蛋白质氨基酸长度为386~847 aa,分子量为43 896.82~95 681.29;等电点为6.52~8.65;平均疏水性为-0.243 264~-0.066 87;该家族成员结构较为保守,每一个南瓜RPW8基因家族成员都具有MLKL_NTD超家族保守结构域;RPW8基因启动子区域含有大量与光响应、茉莉酸、防御和应激、MYB、低温和激素类相关的顺式作用元件;共线性分析发现,南瓜RPW8基因家族成员大部分通过全基因组复制或片段复制产生,仅有1个基因(CmoCh03G010070.1)通过串联重复而来。系统进化分析显示南瓜RPW8可分为RPW8-X和RPW8-NBS这2种类型,且南瓜、笋瓜、西葫芦和墨西哥南瓜亲缘关系相对较近;荧光定量分析显示,CmoCh01G019260.1基因在接种白粉病后的12、24、96 h的表达量上调为对照的3.4、2.2、3.7倍。
关键词:南瓜;RPW8基因家族;进化分析;表达分析;白粉病