《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:李俊仁;吴带娣;赵公政;陈秀珍
单位:1.广州医科大学附属肿瘤医院,广东广州 510095; 2.广州中医药大学中药学院,广东广州 510006; 3.仲恺农业工程学院农业与生物学院,广东广州 510225
摘要:为研究广藿香Trihelix家族基因GT-1的特征及表达特性,以广藿香为材料,根据转录组序列设计特异性引物克隆广藿香GT-1,命名为PatGT-1a,并进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)测定PatGT-1a基因在广藿香不同组织及外源茉莉酸甲酯(MeJA)处理下的表达模式。构建pAN580-EGFP-PatGT-1a表达载体并转化拟南芥原生质体,考察PatGT-1a亚细胞定位。构建pGBKT7-PatGT-1a表达载体,转化Y2HGold酵母,观察其转录自激活活性。结果表明,PatGT-1a开放阅读框(ORF)为1 179 bp,编码392个氨基酸。PatGT-1a为不稳定亲水蛋白,无跨膜结构和信号肽,含有20个丝氨酸磷酸化位点,含有1个GT1保守结构域。进化树分析表明,PatGT-1a属于Trihelix转录因子家族的GT-1亚家族,与一串红(Salvia splendens)SsGT-1的同源性最高。qRT-PCR分析显示,PatGT-1a在广藿香的根、茎、叶中均有表达,尤以根中的表达量最高;在MeJA处理后,PatGT-1a的相对表达量显著提高,在4~24 h呈上升趋势。PatGT-1a定位于细胞核,并具有转录自激活活性。本研究首次克隆并分析了广藿香PatGT-1a基因,研究结果丰富了广藿香Trihelix家族的研究,并为后续研究PatGT-1a的功能奠定了基础。
关键词:广藿香;Trihelix基因家族;GT-1;基因克隆;表达模式;PatGT-1a基因'PatGT-1a基因