极大节旋藻(Arthrospira maxima) HX的全基因组及其比较研究

来源：江苏农业科学杂志2025年第第9期北京时间：

作者：刘海燕;王代玮;王寅初;杨宋琪;罗光宏

单位：1.河西学院甘肃省微藻技术创新中心/甘肃省河西走廊特色资源利用重点实验室，甘肃张掖 734000； 2.中国科学院烟台海岸带研究所，山东烟台 264003； 3.国家基础学科公共科学数据中心，北京 100083； 4.中国科学院海洋大科学研究中心，山东青岛 266071

摘要：旨在通过三代测序技术对极大节旋藻HX进行全基因组测序，以期揭示其基因组结构和功能，并与钝顶节旋藻YZ的基因组进行比较分析。采用PacBio RSⅡ平台进行测序，通过生物信息学方法对获得的基因组数据进行深入分析。结果显示，极大节旋藻HX的基因组大小为6.896 Mbp，呈环状结构，测序覆盖度达到了99.76%。与钝顶节旋藻YZ相比，极大节旋藻HX基因组更大，但两者之间存在良好的基因组共线性，表明它们在进化上具有较高的亲缘关系。极大节旋藻HX的次生代谢途径不发达，但其抗菌性和抗药性相关基因家族显著扩张，显示出较强的适应性。具体而言，HX基因组中与抗菌性和抗药性相关的基因数量和多样性均高于钝顶节旋藻YZ，这可能与其在自然环境中的生存策略有关。此外，极大节旋藻HX基因组中未发现明显的插入和缺失以及倒位、易位等基因组重排事件，这为进一步的遗传改良提供了稳定的遗传背景。本研究不仅成功完成了极大节旋藻HX的全基因组测序，而且通过比较分析，揭示了其基因组特征、与钝顶节旋藻YZ的遗传差异。

关键词：节旋藻;基因组;三代测序;局部共线块;抗菌性基因家族;抗药性基因家族