红花R2R3-MYB转录因子家族鉴定及组织表达分析

来源：江苏农业科学杂志2025年第第9期北京时间：

作者：吴瑶;李丹丹;龙添添;李开杰;余浪

单位：1.贵州大学农学院，贵州贵阳 550025； 2.贵州省药用植物繁育与种植重点实验室，贵州贵阳 550025

摘要：筛选红花(Carthamus tinctorius)在各组织中优势表达的候选MYB基因，以红花基因组测序数据为基础，鉴定红花中MYB转录因子，并分析其理化性质、系统发育、保守基序、二级结构及分析MYB基因在红花5个不同组织部位表达模式。共鉴定到108个红花R2R3-MYB基因，蛋白氨基酸数目为163~996个，理论等电点在4.52~9.55之间，不稳定指数为35.51~76.26，亲水系数为-1.131~-0.448，蛋白相对分子质量为6 092.20~110 047.15 u，所有蛋白均为亲水性蛋白；蛋白二级结构分析发现红花R2R3-MYB蛋白主要由α-螺旋和无规则卷曲构成；通过将其与拟南芥MYB构建系统进化树，发现有91个红花R2R3-MYB转录因子聚类于22个拟南芥R2R3-MYB亚组中，17个红花R2R3-MYB转录因子聚类于2个C亚组中。基于转录组数据的组织表达模式分析筛选在根、茎、叶、花及种子不同组织中优势高表达的MYB基因，发现在根、花及种子中优势表达的MYB基因数目较多，花中特异高表达的R2R3-MYB基因有13个，其中CtMYB6和CtMYB19分别与拟南芥具有调节花青素合成功能的位于S6和S7亚组的基因聚为一类，预测其为参与红花花中有效成分红花黄色素累积的重要候选基因。本研究对红花R2R3-MYB转录因子家族进行了系统鉴定及组织表达谱分析，为后续红花MYB转录因子调节次生代谢成分累积等功能研究奠定基础。

关键词：红花;R2R3-MYB转录因子;生物信息分析;组织表达