《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:付小猛;龙春瑞;杨虹霞;刘红明;毛加梅;杜玉霞;周先艳;魏舒娅;彭忠良;郭莉娜;岳建强
单位:云南省农业科学院热带亚热带经济作物研究所,云南保山 678000
摘要:以2年生盆栽柠檬为研究对象,采用Illumina测序平台进行宏基因组高通量测序,分析不同pH值处理下土壤微生物群落的结构差异,并预测土壤微生物的功能特征。结果表明,酸性(PTLB)处理的柠檬根际土壤微生物多样性明显高于碱性(PTLD)、强碱(PTLE)处理,且物种组成结构差异显著。本研究基于宏基因组学测序得到的物种,隶属于47门116纲221目416科977属3 638种(除去未鉴定微生物),各处理的主要优势菌门均为假单胞菌门、放线菌门、热变形菌门。在属分类水平下对物种绝对丰度排名前20位的菌属进行聚类分析,发现强酸(PTLA)、酸性(PTLB)处理的微生物群落组成更相似,中性(PTLC)、碱性(PTLD)、强碱(PTLE)处理的微生物群落组成更相似,且大部分物种在PTLA、PTLB处理下的相对丰度要高于PTLC、PTLD、PTLE处理。基于EggNOG数据库注释,各处理参与翻译、核糖体结构和生物合成、能量生成与转化、氨基酸转运和代谢的功能基因的相对丰度较高,且PTLB处理中参与氨基酸转运和代谢、能量生成和转化的功能基因的相对丰度显著高于其他处理。相关性分析表明,5个环境因子(土壤脲酶、蔗糖酶、纤维素酶、过氧化氢酶、处理液pH值)对土壤微生物的群落结构和功能均有显著影响,其中处理液pH值的影响最为突出。
关键词:柠檬;pH值;宏基因组测序;土壤微生物;土壤酶活