《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:贾一轩;狄冉;王翔宇;贺小云;龚一鸣;梁琛;储明星
单位:1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/畜禽生物育种全国重点实验室,北京 100193; 2.山西农业大学动物科学学院,山西太谷 030801
摘要:为探究CTSB、PATL2和NOTCH4基因的多态性及其与绵羊产羔数之间的关系,以期寻找绵羊产羔数性状相关的分子标记。结合前期的全基因组重测序结果,筛选这3个基因的候选SNP位点,利用SequenomMassARRAYSNP技术对单羔组(苏尼特羊和巴美肉羊)和多羔组(湖羊、小尾寒羊和策勒黑羊)共5个绵羊品种上述3个基因的候选多态性位点进行基因分型和群体遗传学分析,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果显示,所检测3个基因的5个SNP位点均表现出中、低度多态;CTSB基因g.104438571T>C位点(P<0.05)、NOTCH4基因g.26312001G>A位点(P<0.01)和PATL2基因g.30788209G>A位点(P<0.01)的基因频率在单羔和多羔品种间差异显著;5个绵羊品种的CTSB基因g.104438547G>A位点和NOTCH4基因g.26313972C>G位点及小尾寒羊CTSB基因g.104438571T>C位点均不处于哈迪-温伯格平衡状态(P<0.05),其余各位点在不同品种中均处于平衡状态;CTSB基因g.104438547G>A位点、NOTCH4基因g.26313972C>G和g.26312001G>A位点突变导致了氨基酸改变;关联分析结果显示,所检测3个基因的5个SNP与小尾寒羊产羔数间无显著关联(P>0.05),但胎次对小尾寒羊产羔数有极显著影响(P<0.01)。综上,CTSB、PATL2和NOTCH4基因的5个SNP多态性位点不适合作为小尾寒羊产羔数选育的有效分子标记。
关键词:绵羊;CTSB基因'CTSB基因;PATL2基因;基因'NOTCH4基因;产羔数;SNP分型;关联研究