萝卜扩展蛋白基因家族鉴定及不同生育时期表达模式分析

来源：江苏农业科学杂志2025年第第6期北京时间：

作者：沈峰;刘哲;郑佳秋;王燕;徐良;王薇薇;张丽娜;冯汝超;吴永成;祖艳侠;梅燚

单位：1.江苏沿海地区农业科学研究所，江苏盐城 224002； 2.南京农业大学园艺学院，江苏南京 210095

摘要：为了研究萝卜扩展蛋白基因家族的结构特征与表达模式，对萝卜扩展蛋白基因家族进行全基因组鉴定，并对其系统进化关系、染色体定位、保守基序与基因结构、启动子顺式元件以及不同生育时期表达模式等进行分析。从整个基因组中总共鉴定出52个萝卜扩展蛋白基因家族(RsEXP)成员，系统进化树分析显示该家族共被分为4个亚族，即RsEXPA、RsEXPB 、RsEXLA、RsEXLB。在RsEXP的启动子区域内有多个与植物激素和逆境胁迫相关的顺势作用元件，并且在RsEXP>蛋白序列中预测到多个翻译后修饰位点。染色体定位结果表明，共有45个RsEXP基因定位在萝卜9条染色体上，且在萝卜和拟南芥中共形成70对共线基因。密码子偏好性结果显示，萝卜扩展蛋白中共出现 6 686 个密码子，其中高频密码子有12个。此外，基于转录组数据的表达模式显示，RsEXP基因的表达具有时空特异性，并且不同成员可能在萝卜的生长发育过程中发挥不同程度的作用。研究结果有助于探索RsEXPs基因在萝卜生长和发育中的潜在功能，并为后续机理研究奠定基础。

关键词：萝卜;扩展蛋白;基因家族;生物信息学分析;表达模式;RsEXPs