《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:王培育;张春柳;李尊文;颜沛沛;江金兰;罗维鸿;叶炜
单位:1.三明市农业科学研究院,福建沙县 365051; 2.福建省(山区)作物遗传改良与创新利用重点实验室,福建沙县 365051; 3.福建省宁德市农业农村局,福建宁德 352100; 4.福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002
摘要:TCP基因家族是植物中特有的基因家族,利用生物信息学方法对铁皮石斛TCP基因家族进行全基因组鉴定,通过实时荧光定量PCR分析TCP基因家族成员在不同色系铁皮石斛对光照的响应模式。从铁皮石斛中共鉴定获得31个TCP成员。系统发育树将铁皮石斛TCP成员分为2类,每个成员均具有TCP基因家族特有的保守结构域。同时,相同亚群内TCP成员之间的保守基序相似性强,不同亚群之间保守基序差异较大。另外,启动子分析发现TCP家族成员中存在大量相同的光响应元件,但也存在特异性的元件,表明不同成员间光响应能力的差异性。转录组分析结果显示,不同色系铁皮石斛之间TCP转录因子成员的功能存在差异,同时同一品种铁皮石斛内不同TCP成员的功能存在差异。实时荧光定量PCR结果表明,在红色和绿色铁皮石斛中均存在特异性和普遍性响应光照强度变化的TCP基因家族成员,并且推测Do10016252和Do10014226这2个TCP成员可能是铁皮石斛变红的关键TCP成员。本研究初步探究了光照强度对TCP基因家族成员的影响,以期为进一步了解光照对TCP成员的作用提供参考。
关键词:铁皮石斛;基因家族;不同色系;光照条件