基于转录组测序的不同辣度辣椒差异表达基因分析

来源：江苏农业科学杂志2025年第第6期北京时间：

作者：庞欣;陈军;李林芝;刘佳;黄文娟

单位：1.苏州农业职业技术学院园艺科技学院，江苏苏州 215008； 2.乌兰察布市农林科学研究所，内蒙古乌兰察布012000

摘要：为了研究不同辣度辣椒的基因表达差异，探究参与或调控辣椒素生物合成的基因或转录因子。试验以2种不同辣度的辣椒B1-2(高辣)、D50(微辣)为材料，通过高通量RNA测序(RNA-seq)对35 d胎座进行转录组分析，共筛选出1 570个差异表达基因(DEG)，包括673个上调基因、897个下调基因。经GO富集分析，DEG主要集中在氧化还原反应、光合作用、光反应等生物过程；经KEGG富集分析，DEG主要富集在光合作用-天线蛋白、次级代谢产物的生物合成、代谢途径等信号通路。鉴定出7个CapCyc模型基因、8个MYB转录因子在2份辣椒材料中的差异表达；在果实不同发育时期进一步利用qRT-PCR进行分析，发现4CL、COMT、KAS可能具有调控辣椒素合成的作用。研究结果可为探索辣椒素生物合成的调控网络提供更多的候选基因，期待可为下一步关键基因的功能分析和辣椒育种提供理论基础。

关键词：辣椒;转录组测序;差异表达基因;辣椒素类物质;生物合成;转录因子