《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

藜麦AQP基因家族的鉴定及表达分析

来源:江苏农业科学杂志2025年第第4期北京时间:

作者:曹萌;张侠;胡成浩;高爱红;安珂欣;赵波;张平;郭善利;尹海波

单位:1.烟台大学生命科学学院,山东烟台 264006; 2.青岛农业大学草业学院,山东青岛 266109;3.中藜盐地藜麦(东营)种业科技有限公司,山东东营 257345

摘要:植物水通道蛋白位于生物膜上,是可高效转运水分子的膜内在蛋白,参与植物的多种逆境胁迫应答过程。为了研究藜麦水通道蛋白基因家族CqAQP的相关功能,基于藜麦全基因组信息,采用生物信息学方法鉴定藜麦CqAQP基因家族成员。藜麦CqAQP家族共有55个成员,根据系统发育分析分为4个亚家族:NIP、PIP、SIP和TIP。CqAQP散布在除了8、9、12号的其他染色体上;亚细胞定位预测家族成员主要位于细胞膜和液泡膜。CqAQP基因含有2~6个外显子,1~5个内含子。片段重复和串联重复是CqAQP基因家族的主要扩增途径。CqAQP基因启动子区包括非生物胁迫响应、激素响应以及与生长发育相关的顺式作用元件;基于转录组水平的组织和非生物胁迫表达模式分析发现,藜麦CqAQP基因组织差异性表达明显,且大部分CqAQP基因对盐、干旱、热和低磷胁迫有响应。

关键词:藜麦;水通道蛋白;基因家族分析;非生物胁迫;基因表达

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