《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:郭震华;马文东;蔡丽君;蔡永盛;胡月婷;韩笑;田崇兵;张希瑞;王翠
单位:1.黑龙江省农业科学院水稻研究所,黑龙江佳木斯 154026; 2.黑龙江省农业科学院佳木斯分院,黑龙江佳木斯 154007
摘要:水稻作为世界重要的粮食作物,极易受到低温侵袭,并伴随着水稻机体内一系列复杂的代谢变化及分子水平调控,以适应低温逆境。为了明确寒地水稻孕穗期低温胁迫应答的关键调控通路及基因,采集龙粳11(LG11)在孕穗期低温处理下0、2、4 d的幼穗,用于孕穗期低温胁迫的转录组动态分析。结果共鉴定得到14 236个差异表达基因(DEG),其中,低温处理前2 d共得到11 724个DEG,在低温处理4 d后共识别了11 057个DEG。GO功能富集分析,LG11低温处理共包含144个显著富集的生物进程GO类别,其中富集DEGs数量最多的集中在光合作用、叶绿体重定位、红外光应答等光合作用相关类别。KEGG富集分析共显著富集到37个KEGG通路,其中与光合作用相关的光合作用-天线蛋白等KEGG通路显著富集下降,进一步明确龙粳11光合作用在孕穗期低温下显著受抑制。这些结果为后续水稻孕穗期低温胁迫应答中转录组水平上的分子调控提供了理论指导。
关键词:水稻;孕穗期;低温;转录组测序