《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:林宇清;朱渊铭;陈丝雨;陈德星;张琼艺;陈淑颖;张培兰;邹双全
单位:福建农林大学林学院/自然生物资源保育利用福建省高校工程研究中心,福建福州 350002
摘要:为明确栀子TCP基因家族及盐胁迫响应,利用生物信息学手段对栀子TCP基因家族进行鉴定、分析和盐胁迫表达试验分析。结果表明,在栀子中共鉴定出16个TCP基因,分为PCF、CYC和CIN共3个亚家族。保守基序、基因结构和理化性质表明,同亚家族基因保守基序相似,不同亚家族的基因保守基序差异较大,16个栀子TCP基因均为亲水蛋白。染色体定位表明,16个栀子TCP基因不均匀地分布在8条染色体上,且包含多个片断段复制事件。顺式作用元件分析发现,栀子TCP基因中含有多种与植物生长发育、应激反应及激素调节相关的作用元件,以胁迫响应元件MYB和MYc最多;盐胁迫表达量显示,栀子TCP基因均能响应盐胁迫,部分基因在重度盐胁迫特异性表达,推测GjTCP13、GjTCP12和GjTCP6可能为栀子耐盐调控的关键基因。综上所述,栀子TCP基因家族成员能够积极响应盐胁迫,增强栀子的耐盐抗性。
关键词:TCP基因家族;栀子;生物信息学;盐胁迫