《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:陆佳欣;王宇翔;赵杰银;于江野;胡欣贵;陈全家;曲延英
单位:新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心,新疆乌鲁木齐 830052
摘要:基于棉花基因组数据,系统地鉴定了棉花DUF677基因家族成员,对海岛棉DUF677基因家族进行了系统的进化分析。在海岛棉、陆地棉、雷蒙德氏棉、亚洲棉、拟南芥和水稻中,共鉴定出158个DUF677基因家族成员,其中海岛棉基因组中包含40个成员,分布在17条染色体上,进化树分析表明可分为3个亚族。海岛棉DUF677亚细胞定位预测主要在细胞质或细胞核中,均为亲水性蛋白质,含有1个外显子,至少含有1个基序和有DUF677结构域。通过启动子分析发现,含有与茉莉酸甲酯及水杨酸相关的顺式作用元件最多。结合启动子和表达分析,推测GbDUF677-01、GbDUF677-14、GbDUF677-21、GbDUF677-22、GbDUF677-24和GbDUF677-35可能参与了海岛棉对枯萎病的胁迫过程。进一步使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对这6个基因在抗感枯萎病的极端材料中进行枯萎病胁迫后的表达分析,发现这6个基因均受枯萎病胁迫的诱导表达,其中GbDUF677-14和GbDUF677-21在抗病材料中的表达最大可达到胁迫前的6倍,说明这2个基因可能参与了海岛棉抗枯萎病过程。本研究结果表明DUF677基因家族在海岛棉抗枯萎病方面具有重要作用。
关键词:海岛棉;枯萎病;胁迫;生物信息学;DUF677基因家族