甜瓜GATA基因家族的鉴定及表达分析
来源：江苏农业科学杂志2025年第第4期北京时间：
作者：侯银鹤;张永平;姚东伟;刁倩楠;田守波;乔宏宇;曹燕燕
单位：1.吉林农业大学园艺学院，吉林长春 130118； 2.上海市农业科学院园艺研究所/上海市设施园艺技术重点实验室，上海 201403
摘要：GATA转录因子是一类广泛存在于真核生物中具有Ⅳ型锌指结构域的转录因子，在植物生长和发育过程中起重要作用。GATA基因家族已在各种植物中被发现，但是目前尚无甜瓜GATA转录因子的报道。为此，利用生物信息学对甜瓜GATA家族基因成员进行了全基因组鉴定与分析。结果表明，甜瓜基因组中共鉴定到25个GATA基因，这些基因不均匀地分布在10条染色体上。25个GATA基因编码的氨基酸长度在131～565 aa之间，蛋白分子量在1413～63.04 ku之间，等电点范围介于3.63～9.71之间，80%定位在细胞核。根据进化关系可将甜瓜GATA家族分为3个亚族，分别包含了6、8、11个成员。启动子分析发现，GATA基因家族上游存在大量与植物激素、光信号和逆境相关的顺式作用元件，显示可能存在多种转录调控。基因组织表达模式分析结果表明，约50%GATA家族成员在甜瓜不同组织中呈不同程度的特异性表达。采用qRT-PCR方法对白粉病菌胁迫下的6个甜瓜GATA基因的表达水平进行分析，结果表明GATA基因家族可能参与甜瓜对白粉病菌侵染的响应。
关键词：甜瓜;GATA转录因子;基因家族;表达模式;胁迫响应;白粉病
