《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:倪睿; 王海娟; 王文博; 丁荣荣; 吉维维; 刘晓红; 王国平; 郭新勇
单位:1.石河子大学生命科学学院,新疆石河子 832000; 2.新疆生产建设兵团第七师农业科学研究所,新疆奎屯 833200; 3.新疆前海种业有限责任公司,新疆图木舒克 843900
摘要:陆地棉(Gossypium hirsutum L.)作为重要的天然纤维作物,常受棉铃虫(Helicoverpa armigera)危害。为探究GhTIFY5A在棉花抗虫响应中的潜在调控作用,为后续功能验证及抗虫基因筛选提供理论依据,以陆地棉18BZ6为材料,利用生物信息学分析其理化性质及结构,克隆该基因并通过qRT-PCR分析陆地棉在虫食胁迫过程中GhTIFY5A的表达量差异变化。结果表明,成功克隆的GhTIFY5A基因的CDS为360 bp,编码蛋白含119个氨基酸(分子量13.7 ku,等电点9.60),具有保守的TIFY和Jas结构域,分别在100~192氨基酸位点和292~354氨基酸位点,属于亲水性不稳定蛋白,无信号肽及跨膜结构,二级结构以无规则卷曲(67.23%)和α-螺旋(21.85%)为主,主要定位于细胞核,三级结构同源建模显示高可信度(GMQE=0.70),预测含有11个丝氨酸和5个苏氨酸磷酸化位点。系统进化分析显示,GhTIFY5A与野西瓜苗、大麻槿和木槿的TIFY5A蛋白亲缘关系最近。虫食胁迫下表达动态发现GhTIFY5A表达极显著上升,3 d达到峰值,相较于3 d,5 d表达显著降低,7 d仍然维持在高于基础水平状态,说明棉铃虫取食对于GhTIFY5A基因的表达有一定的影响。
关键词:陆地棉;虫食胁迫;基因克隆;表达分析