《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

甘蓝型油菜肌球蛋白基因家族全基因组鉴定与胁迫响应表达分析

来源:江苏农业科学杂志2026年第第10期北京时间:

作者:陈琢;王政

单位:江苏大学生命科学学院,江苏镇江 212013

摘要:为研究肌球蛋白基因家族的结构特征、表达模式及胁迫响应,使用生物信息学手段鉴定甘蓝型油菜肌球蛋白基因家族并对其家族成员进行共线性分析、理化性质分析、系统发育分析、蛋白选择性压力分析、启动子分析、基因保守结构域分析、基因结构分析以及多种条件下的表达模式分析。结果显示,共有52个基因被鉴定为甘蓝型油菜肌球蛋白基因家族成员。系统发育分析结果表明,这52个基因属于Ⅷ类与Ⅺ类肌球蛋白基因。蛋白理化性质分析结果表明,这些基因编码的蛋白均为不稳定且热稳定性差亲水蛋白。亚细胞定位结果显示,它们普遍定位于细胞质中。这52个基因分别定位于甘蓝型油菜的18条染色体上。共线性分析与蛋白选择性压力分析结果显示,52个甘蓝型油菜肌球蛋白基因来源于17个拟南芥肌球蛋白基因,且在进化过程中受到高度纯化选择。启动子分析结果显示,甘蓝型油菜肌球蛋白基因启动子区域普遍存在植物激素与胁迫响应顺式作用元件。多种胁迫下的转录组数据显示,部分甘蓝型油菜肌球蛋白基因响应干旱、冷冻、盐胁迫。RT-qPCR分析结果表明,部分甘蓝型油菜肌球蛋白基因的表达受到菌核病侵染调控。这些结果表明甘蓝型油菜肌球蛋白基因家族成员响应多种胁迫,为进一步探究肌球蛋白基因家族在甘蓝型油菜中的生物学功能奠定了基础。

关键词:甘蓝型油菜;肌球蛋白基因家族;生物胁迫;非生物胁迫;全基因组鉴定;表达分析

填文献完整题目 获取完整文献

填写需求
联系方式
注:学术顾问会在1小时内联系您,请留意!