《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:陈为;张琳;张卫凯
单位:1.洛阳职业技术学院河南省王云龙中原学者工作站,河南洛阳 471000; 2.洛阳理工学院生命科学与健康工程学院,河南洛阳 471000
摘要:Trihelix转录因子在植物生长发育及非生物胁迫响应中具有关键作用,目前已在拟南芥、水稻等模式植物中开展相关研究,但在麻风树中尚未见报道。为鉴定麻风树Trihelix基因家族成员,解析其生物信息学特征及表达模式,为抗逆育种提供候选基因。研究基于麻风树基因组数据,通过HMM搜索、系统发育分析等生物信息学方法,结合表达谱数据探究基因在不同组织及盐、干旱胁迫下的表达情况。结果表明,共鉴定出32个JcGT基因,可分为5个亚家族及2个孤儿基因;其中28个基因分布于9个连锁群,4个位于未定位的scaffold上,且仅存在3个片段复制事件。多数基因表达较为稳定,JcGT27在花芽中特异性表达;盐胁迫下JcGT-6、JcGT-9在根中显著上调表达,干旱胁迫下JcGT-18、JcGT-29等在根中上调表达,而JcGT-16、JcGT-26对2种胁迫均有响应。本研究首次完成了麻风树Trihelix基因家族的全基因组分析,证实片段复制是其扩张的主要驱动力,筛选出的关键候选基因可为后续功能研究及抗逆作物培育提供理论依据。
关键词:Trihelix基因家族;麻风树;盐胁迫;生物信息学分析;干旱胁迫;表达模式